用人单位扣除工资，我申请劳动仲裁申请用人单位还是第三方劳务公司？

依据你们合同约定处理
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劳动者可以通过申请劳动仲裁的方式讨要薪水，申请劳动仲裁的话，必须要符合劳动仲裁的受案条件。
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用人单位拖欠或克扣工资，劳动者可以向劳动监察大队投诉或者直接申请劳动仲裁维权。维权时应注意收集整理必要的证据，如工作服、工资条、工牌证人等。